浦上天主堂原是一座砖砌新罗马风格建筑，建于1895年2月。
1865年，法国神父Bernard Petitjean发现几乎全体浦上村民均为岛原之乱后隐匿下来的天主教徒。1869年和1873年之间，有超过3600名村民遭到驱逐。在流亡的7年期间，有650人死亡。1873年，受迫害的隐藏基督徒回到他们的家乡，决定建立自己的教堂。他们购买的土地，是在两个世纪中曾经遭受屈辱盘问的地方。一年一度的「踏绘」要求践踏圣母像或耶稣像。他们认为这个地方是纪念长期迫害的适当地点。建筑由Francine神父始建。两座钟楼高64米，建于1875年。到1925年完成时，为东亚最大的天主教堂。
1945年8月9日，美国陆军航空军轰炸机将原子弹投在长崎，在浦上一带引爆，将距离原爆点仅有500米的教堂彻底摧毁。当时许多基督徒正聚集在教堂举行弥撒，庆祝圣母升天节，由于射线和倒塌的石头而全部身亡。
新堂建于1959年。此前长崎市政府和教会之间进行了严肃的辩论。市政府建议保留被毁的教堂为历史遗产，另外提供地点新建教堂。然而，出于历史原因，长崎的基督徒强烈希望在原址重建他们的教堂。这个地方是他们遭受迫害和痛苦的象徵。1980年改造后，更为接近原来的法国风格。
在轰炸中受损的雕像和文物，包括一口法国钟，现在仍陈列在堂外。附近的和平公园内有原教堂牆壁的遗蹟。
现今已成为长崎市的著名景点。目前堂区所属教友总数约7千人，在日本名列前茅。
诚恳的邀请各位教友一起来参与
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